刚毛藻实际上是一种丝状藻，可摸起来并没有水绵一样的滑滑的感觉，反而会有坚硬的感觉。刚毛藻属于高等藻类，其体内含有的叶绿素和高等植物是一样的，而且基部细胞有假根或呈假根状，可以附着在基质上。刚毛藻对于二氧化碳浓度较低的水质适应能力非常强，当水体中二氧化碳含量不足时，刚毛藻可以迅速地利用碳酸氢根来充当碳元素的来源，而不像其他水草还需要一段时间来适应。
刚毛藻主要生长在直接受到光照的硬景观的介质上，在严重的情况下，也会长在水草上面。不过刚毛藻通常会聚集在某个位置，很容易加以移除。大部分工具鱼虾，对刚毛藻没有兴趣，我们可以通过手工摘除或者药剂的局部喷射的办法进行根除。