简单地说，pH值是一种在化学上专门用于简化描述氢离子浓度的参数，也可以用来描述水质的酸碱度，即当pH值等于7时，水质呈中性；低于7时，水质呈酸性；高于7时，水质呈碱性。除非pH值过高或过低，直接伤害到水草的细胞，否则它对水草育成的影响通常是间接的，而不是直接的。其影响层次主要有两个层面：
首先，pH值会影响养分的有效性或肥料的溶解度。举例来说，铁肥在pH值高于7的水体中很容易被氧化而失效，或溶解度较低，所以在碱性水质中，铁肥的肥效会降低；不过对钼肥来说，刚好相反，在酸性水质中，钼肥的肥效会降低。
其次，植物细胞原生质膜对营养盐的透过性会显著地受到pH值的影响，使得水草对养分的吸收效率，可能会受到pH值的促进或抑制。举例来说，铵及硝酸盐都是水草的氮肥，但在碱性较强的水质中，水草对铵的吸收效率会受到促进，但它对硝酸盐的吸收效率会受到抑制；反之，正好相反。又如，对钙肥而言，在碱性水质中，可促进水草对钙肥的吸收作用，但在酸性水质中，刚好相反。许多水草在pH值为7.0-6.0范围内的水质，或中至弱酸性的水质中是最适合生存的，而且跟热带鱼也可以共存，所以如果能将缸水的pH值控制在这个范围内，对水草缸的管理最有利。
为了控制pH值，必须对缸水的pH值进行测定，通常的测定方法是使用pH测试剂，或使用pH测试笔或测试仪。如果测试结果，发现pH值有偏高或偏低的现象，必须设法改善。
例如，可以利用市售pH值调降或调升剂处理，使其回复到合适的范围内。但是有些特殊情况的pH值始终居高不下，而且不容易改善，最主要的原因除了跟原来水源偏碱之外，底砂中混有珊瑚砂则是最常见的案例，因为珊瑚砂中含有石灰质（碳酸钙）会中和酸度，纵然使用pH值调降也仅是暂时性而已，不久又恢复处理前的状况，除非珊瑚砂不存在，否则很难做彻底的改善。遇到此种情况时，似乎只有更换底砂一途，才是一劳永逸的解决办法。
也有另一种pH值过低得情况，是使用人造的酸性底质所造成的，这些人造底质铺设于底床，会不断释放出酸性成分而使水质酸化。如果用量太多，或它们释放出酸性成分之能力较强，也可能造成pH值过低的现象，不过这种现象通常只发生于使用初期而已，不久之后应该会自动改善。